进入2023年以来,在AI赋能药物发现领域,多个技术平台密集发布,其中大多数集中在3月下旬发布。今年一季度国内发布的技术平台及其功能如下。
1.天壤XLab:xCREATOR
天壤XLab在2022年9月推出蛋白质设计工作台xCREATOR后,又于今年1月率先升级xCREATOR的蛋白质设计模块。此次更新重新定义了用户基于工作台的创造力,原来只能围绕“功能目标”展开设计,更新后的平台可以进行自由设计、复合体设计、对称蛋白质设计等更多样的结构生成。
2.英飞智药:PharGPT
2月14日,英飞智药宣布,公司与北京大学共同研发的药物设计版ChatGPT工具PharGPT已集成到PharmaMind客户端V3.8版本中。
PharmaMind是集成人工智能和计算模拟设计技术的创新药物研发平台,目前已经发布了两个内部版本用于新药研发。经过实际用户场景的内部打磨,PharmaMind V3.0开始对外发布实用的功能模块。
3.晶泰科技:XtalDynamics
3月3日,晶泰科技发文介绍了其自主研发的实验室自动化系统XtalDynamics。
采用人机结合模式的XtalDynamics自动化系统实现了实验过程的高度自动化和智能化,通过智能分析与调度系统远程操控百台规模自动化工站和AGV小车,同时提升实验过程和物料传送的效率。系统可7×24小时不间断运行,并实时记录实验过程数据和结果,有效保证了实验记录的及时性、完整性、规范性和可追溯性。
4.星药科技:M1平台
3月3日,星药科技M1平台升级。
M1是星药科技自主研发的、面向药物发现和设计的Al驱动智能计算平台。其结合了人工智能和经典物理学原理,可快速准确描述分子和蛋白质间的相互作用,精确计算目标药物分子和特定靶标的结合自由能,突破了经典计算模拟方法。
M1平台的自由能微扰模块GFEP和分子对接模块GDock也在实际管线研发业务中展现了优越性能。本次M1升级上线的高通量分子对接版本。经过计算资源和工程优化后,对接打分可达到30万分子/小时/GPU(不含构象生成)的速度,采用单个GPU一天半时间内即可完成千万级分子库的筛选。
5.明度智云:MSP
3月17日,明度智云正式发布明度科学平台(MSP),旨在构建药物研发基础设施,提高药物研发效率,降低药物研发门槛。明度科学平台作为生命科学统一平台,创新性地打通药企和CXO企业,面向药物研发全业务流程,以丰富的应用组合实现数据高效融合,解决药物研发遇到的挑战。
6.阿尔脉:PatMap
3月21日,阿尔脉PatMap专利解析软件上线。PatMap是阿尔脉基于并行计算、虚拟化等技术构建的交互便利、高度自动化的专利解析软件。整个系统建立在标准的B/S架构基础上,支持Chrome等主流浏览器,可操作性强。PatMap集合了数据缓存、对象存储、容器化、微服务、消息机制、应用虚拟化等多项先进的开发技术,通过调用云计算部署模式,可动态调度系统资源,满足不同的业务场景需求,支持高并发并同时兼顾服务的可靠性。
7.深势科技:RiDYMO
3月23日,深势科技发文介绍了RiDYMO平台。RiDYMO平台是基于Reinforced dynamics(RiD)算法开发的专注于解决“难成药”靶点的动力学平台。对比其它动力学算法和平台,RiDymo最核心的优势体现在模拟采样效率上的巨幅提升,同时充分结合神经网络的高维表示能力,在复杂的生物大分子体系中高效捕捉动态的构象变化,在相对可控的算力资源和模拟时长条件下就可以让蛋白真正“动”起来。
此前的2022年10月29日,深势科技在上海发布了新一代药物计算设计平台Hermite。Hermite致力于为药物研发工作者提供CADD中数据、算法、算力三位一体的一站式解决方案。
8.百图生科:AIGP
3月23日,百图生科发布生命科学大模型驱动的 AIGP——AI Generated Protein 平台,旨在将这一技术平台的能力与行业伙伴分享,利用设计创新蛋白质的能力,共同研发更多的前沿药物和其他生命科学项目,也通过挑战性的新任务,驱动AIGP平台的技术进步。
目前,百图生科AIGP平台设置了3类功能模块,分别是Function to Protein Design(F2P,根据结构、功能、可开发性等功能指标设计/优化蛋白质)、Protein to Protein Design(P2P,给定抗原等目标蛋白,设计与之以特定方式结合的抗体等蛋白),以及Cell to Protein Design(C2P,给定细胞,发现调控细胞功能的靶点蛋白并设计相应的调控蛋白)。
9.碳硅智慧:DrugFlow1.0
3月24日,新药研发领域的人工智能基础设施和服务提供商碳硅智慧宣布,公司自主研发的新药研发平台DrugFlow1.0正式发布。
DrugFlow涵盖靶标发现、苗头化合物发现和先导化合物优化等环节,集成了世界领先的靶标发现、活性预测、成药性预测、分子生成优化、虚拟筛选、AI建模等模块,帮助药化专家更高效便捷地找到潜在成药分子。
此次发布的DrugFlow1.0版本,主要发布了活性预测、成药性预测、分子生成、AI建模四大功能。
10.杭州生奥信息:MolProphet
3月23日,杭州生奥信息发布药物发现平台MolProphet 。
该平台包含了整体分子优化(以扩展活性结构,实现骨架跃迁为目标)、基于母核优化(保留关键结构,提升活性与类药性)、基团优化(通过对指定药效团优化,实现属性的定向提升)等多项功能。
11.腾迈医药:TandemViz
3月28日,腾迈医药发布TandemViz 1.0版本。TandemViz可以为腾迈不断增长的新药研发客户群体提供用户友好的图形界面和高效的团队协作工具。
客户可通过浏览器直接访问工具平台,不需要安装任何软件,即可调用腾迈的计算工具套件,并实现实验数据和计算分析结果的可视化无缝集成。 (智药邦整理)